Het venster heeft drie deelvensters: links de zijbalk, in het midden de lijst met notities en rechts de geopende notitie.
Bestand ▸ Nieuw (Ctrl+N) of de knop + boven de lijst maakt een notitie bovenaan de lijst. De eerste regel van een notitie is haar titel. Paragraph slaat elke notitie zelf op; Bestand ▸ Opslaan… (Ctrl+S) slaat haar meteen op.
Klik op een notitie om haar te openen. Shift+klik en Ctrl+klik selecteren meerdere notities. Dubbelklikken opent de notitie in een eigen venster. Klik met de rechtermuisknop op een notitie voor Ster, Prullenbak en de kleuren. Klik op de titel boven de lijst om de volgorde te kiezen: Wijzigingsdatum, Aanmaakdatum, Titel (A–Z) en Notities met ster eerst.
De zijbalk toont Notities, Recent, de prullenbak, de kleuren, de tags en de notities met ster. Beeld ▸ Zijbalk (Ctrl+Shift+M) toont of verbergt hem; Beeld ▸ Uitgebreide zijbalk (Ctrl+Alt+Shift+M) toont de namen naast de pictogrammen. Sleep notities naar een kleur of een tag om ze die kleur of tag te geven.
Het menu Kleuren geeft de geselecteerde notities een van elf kleuren. #woord in een notitie voegt de tag woord toe; klik met de rechtermuisknop op een tag in de zijbalk om hem te hernoemen of te verwijderen.
Het vergrootglas boven de lijst (Ctrl+F als de lijst op de voorgrond staat) doorzoekt de titels en de tekst van al je notities.
Prullenbak verplaatst een notitie naar de prullenbak; in de prullenbak haalt Herstellen haar terug.
Help ▸ Voorbeeldnotities maken… voegt een paar notities toe die laten zien wat Paragraph kan. Je eigen notities blijven ongemoeid.